98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0427 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 289 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  90.31 
 
 		 289 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  77.66 
 
 		 291 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  36.5 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  36.07 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  36.65 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  35.11 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  36.26 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  38.11 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  35.27 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  34.18 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  34.18 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  38.11 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  34.55 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  33.69 
 
 		 305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  34.18 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  31.29 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  33.45 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  33.45 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  33.82 
 
 		 462 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  33.45 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  32.35 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  37.22 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  29.64 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  34.3 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  34.3 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  32.61 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  33.1 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  30.18 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  31.23 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  28.68 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  30.36 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  30.63 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  29.28 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  32.12 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  29.67 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  32.22 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  32.22 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  32.97 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  30.69 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  31.1 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  31.03 
 
 		 473 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  29.54 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  31.48 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  29.54 
 
 		 417 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  29.79 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  29.18 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  29.18 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  29.18 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  29.18 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  29.89 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  32.97 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  31.1 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  30.6 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  32.62 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  31.1 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  30.6 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  30.6 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  31.48 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  32.06 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  31.43 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  32.02 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  38.1 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  34.95 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  38.89 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  37.5 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  37.5 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  37.5 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  37.5 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  37.68 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.25 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3011  hypothetical protein  28.68 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.73723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  25.1 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  24.5 
 
 		 424 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  28.7 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  28.87 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 357 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>