30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2203 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 319 aa  668    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  25.88 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  26 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  24.7 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  24.58 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  24.75 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.08 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  24.08 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.42 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  23.57 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  24.41 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  21.32 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  21.74 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  21.74 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  21.89 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  21.11 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  20.81 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  24.85 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  21.54 
 
 		 279 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  20.92 
 
 		 1150 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  24.2 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  21.53 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  20.26 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>