79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3535 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  100 
 
 
336 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  90.18 
 
 
336 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  65.41 
 
 
329 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  66.77 
 
 
329 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  66.45 
 
 
342 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  66.98 
 
 
329 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  67.72 
 
 
330 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  65.22 
 
 
342 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  66.45 
 
 
342 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  65.81 
 
 
330 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  29.26 
 
 
302 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
319 aa  95.9  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
308 aa  89.4  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
333 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
309 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  28.73 
 
 
328 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  27.05 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  27.93 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  28.47 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.22 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.42 
 
 
1152 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3517  acyl-CoA synthetase  24.68 
 
 
989 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
268 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
275 aa  49.3  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.22 
 
 
464 aa  49.3  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
272 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  33.33 
 
 
1152 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 
308 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
277 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.99 
 
 
530 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.42 
 
 
266 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  27.47 
 
 
314 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  38.95 
 
 
305 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  26.69 
 
 
294 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  28.05 
 
 
328 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  23.73 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3301  acyl-CoA synthetase  23.96 
 
 
991 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  25.74 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  25.74 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  25.74 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  25.74 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2977  acyl-CoA synthetase  21.54 
 
 
1005 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120124  normal  0.0134257 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  25.74 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  25.74 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3006  acyl-CoA synthetase  21.54 
 
 
1005 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2962  acyl-CoA synthetase  21.54 
 
 
1005 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
295 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  25.26 
 
 
279 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  22.9 
 
 
1150 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 
248 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  29.49 
 
 
358 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 
230 aa  43.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 
271 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  27.47 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>