46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2091 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
329 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  85.45 
 
 
330 aa  577  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  75.08 
 
 
329 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  73.82 
 
 
330 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  73.09 
 
 
342 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  74.13 
 
 
342 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  73.5 
 
 
342 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  66.77 
 
 
329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  66.98 
 
 
336 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  66.35 
 
 
336 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  28.32 
 
 
302 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
274 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  25.55 
 
 
303 aa  90.5  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
302 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  24.65 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  24.4 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  26.19 
 
 
334 aa  62.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
357 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.71 
 
 
357 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
368 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.71 
 
 
1152 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  32.05 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.07 
 
 
1152 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 
258 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.36 
 
 
1132 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4478  hypothetical protein  34.78 
 
 
367 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  hitchhiker  0.00262511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  30.66 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1997  AB-hydrolase associated lipase region  30.17 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140936  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
272 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>