64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1601 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 342 aa  688    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  88.89 
 
 		 342 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  87.72 
 
 		 342 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  87.58 
 
 		 330 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  77.19 
 
 		 329 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  73.5 
 
 		 329 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  73.27 
 
 		 330 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  69.09 
 
 		 329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  66.45 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  65.18 
 
 		 336 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  28.41 
 
 		 302 aa  99.4  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  27.56 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  26.33 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  26.58 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  29.47 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.29 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 258 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.74 
 
 		 1132 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  26.81 
 
 		 305 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.15 
 
 		 1152 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.96 
 
 		 1152 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 264 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  25.22 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3995  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 465 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  33.04 
 
 		 258 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  25.59 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  23.7 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1997  AB-hydrolase associated lipase region  30.25 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  28.18 
 
 		 259 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05760  lipid particle protein, putative  27.27 
 
 		 652 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  32.58 
 
 		 256 aa  43.1  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  40.58 
 
 		 251 aa  43.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1715  dienelactone hydrolase  31.53 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.352882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 315 aa  42.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>