66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1956 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 335 aa  706    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  25.8 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  27.06 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  26.58 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  23.95 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.82 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  25.91 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  25.58 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.49 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  26.07 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  19.74 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  19.34 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 248 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  22.4 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  22.4 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  20.83 
 
 		 368 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  22.8 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 273 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  25.58 
 
 		 303 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  25.12 
 
 		 256 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  22.67 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  21.15 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46290  poly(3-hydroxybutyrate) synthase subunit  21.79 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335003  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  22.98 
 
 		 261 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.33 
 
 		 280 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  20.45 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.87 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2043  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.87 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.12 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  27.42 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  33.68 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.33 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 250 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  23.36 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.19 
 
 		 1150 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  31.37 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.85 
 
 		 291 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  27.18 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  27.18 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  23.58 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  21.31 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  23.9 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.74 
 
 		 273 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  27.18 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0181  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 268 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>