81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2086 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  68.39 
 
 		 329 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  66.26 
 
 		 330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2091  esterase/lipase/thioesterase family protein  66.77 
 
 		 329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226093  hitchhiker  0.00381064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  69.09 
 
 		 342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  65.54 
 
 		 330 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  65.85 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  67.19 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  66.77 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  64.58 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1224  hypothetical protein  26.95 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1008  hypothetical protein  27.51 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.884011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  26.76 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 333 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 325 aa  99.4  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0195115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2816  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3372  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1047  hypothetical protein  27.15 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3221  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3360  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 331 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.110045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3042  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3222  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1146  alpha/beta hydrolase fold protein  25.25 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2203  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832977  decreased coverage  0.00859748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  29.17 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1479  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.12 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.25 
 
 		 1152 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1152 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  26.28 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  26.43 
 
 		 473 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  26.32 
 
 		 417 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.06 
 
 		 1132 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  26.32 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  31.19 
 
 		 259 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  25.09 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  33.33 
 
 		 618 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  30.92 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  25.27 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05760  lipid particle protein, putative  26.76 
 
 		 652 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  30.72 
 
 		 618 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4478  hypothetical protein  29.52 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.637104  hitchhiker  0.00262511 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  27.27 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  33.93 
 
 		 618 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 256 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  27.89 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  27.89 
 
 		 256 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  27.89 
 
 		 256 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  27.89 
 
 		 256 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.14 
 
 		 245 aa  42.7  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  25.08 
 
 		 298 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>