233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 245 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0131  putative hydrolase  38.67 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  42.86 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  51.09 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  48.78 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  42.7 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  43.96 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  37.24 
 
 		 330 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  38.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 300 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  47.67 
 
 		 314 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  40.91 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 338 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.57 
 
 		 368 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  25.19 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.57 
 
 		 368 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  43.96 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.57 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  33.65 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  35.92 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  30 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  32.41 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6025  hypothetical protein  37.23 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.82 
 
 		 370 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 262 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 265 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.06 
 
 		 371 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.06 
 
 		 371 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 262 aa  48.5  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  46.77 
 
 		 284 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  46.77 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.5 
 
 		 372 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  27.69 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.06 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  46.51 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  39.33 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.06 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.18 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  40.45 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.01 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.35 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  30 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  41.57 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5853  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 340 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.61 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 305 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 340 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3251  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 		 322 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.31 
 
 		 374 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 296 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  33.08 
 
 		 384 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 340 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 340 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 340 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  43.48 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39469  predicted protein  35.58 
 
 		 306 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.696258  normal  0.903169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  38.54 
 
 		 341 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  36.36 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.94 
 
 		 370 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.16 
 
 		 370 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 279 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  35.63 
 
 		 256 aa  45.4  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.96 
 
 		 277 aa  45.4  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  38.04 
 
 		 309 aa  45.4  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>