More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0131 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0131  putative hydrolase  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.67 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  26.97 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  28.52 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  33 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  41.76 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 312 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 312 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.58 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 312 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  43.96 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 294 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 301 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  37.72 
 
 		 322 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.21 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 		 333 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  41.24 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25 
 
 		 2762 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 		 349 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 373 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  26.82 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.23 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  26.82 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  43.48 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  26.82 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  36.11 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  26.82 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  26.82 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  26.82 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 281 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  26.82 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  42.37 
 
 		 320 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  35.42 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 302 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 		 315 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 302 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 302 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 		 277 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 336 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 		 335 aa  48.5  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 307 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 		 350 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  31.63 
 
 		 356 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 		 340 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 343 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  22.27 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  49.09 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 		 360 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.44 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  40.7 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  26.44 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 387 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8394  putative hydrolase  40.7 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  40.43 
 
 		 301 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>