More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2728 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  42 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0849  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.33 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  35.79 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  42.71 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  43.33 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  37.78 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  33.94 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  42.22 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  39.33 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  40.43 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.7 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  31.75 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  41.91 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  33.62 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  31.75 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  41.76 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.7 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 404 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.81 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 877 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  36.36 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  35.34 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  38.54 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  30.28 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  33.62 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  39.33 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  40.91 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.71 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>