More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3251 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3251  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1862  Alpha/beta hydrolase  70.4 
 
 		 259 aa  351  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3348  alpha/beta hydrolase fold  69.32 
 
 		 259 aa  324  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  68.92 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  68.92 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  45.02 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1451  Alpha/beta hydrolase  38.17 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2442  putative hydrolase  35.37 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  34.62 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.68 
 
 		 562 aa  65.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  25.21 
 
 		 387 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.45 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.2 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.2 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 309 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  29.76 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  34.31 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  27.38 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.8 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4392  putative dioxygenase  35.19 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  30.19 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  32 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  32.74 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.83 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 		 340 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 346 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  22.53 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  34.29 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  34.29 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  33.33 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  35.24 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.83 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  26.42 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  33.64 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  28.5 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.89 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4229  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  41.77 
 
 		 343 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  30.89 
 
 		 453 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  32.41 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  31.53 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  22.4 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>