291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3622 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
301 aa  587  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  44.02 
 
 
288 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  41.31 
 
 
284 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  38.82 
 
 
278 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
279 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  32.41 
 
 
308 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  36.8 
 
 
298 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  36.36 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  35.74 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  31.54 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  31.54 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  32.77 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  31.46 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  32.42 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  32.64 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  30.34 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  30.34 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  29.76 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  29.84 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  29.89 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  28.82 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  29.37 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  32.77 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  25.9 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  33.61 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  35.32 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  35.68 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  30.04 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  32.34 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  28.24 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  28.05 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  28.05 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  29.86 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  28.05 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  28.05 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  28.69 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  34.02 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  27.48 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  28.63 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  39.13 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  32.5 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  29.91 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  28.05 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  28.65 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  29.13 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  22.06 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  29.63 
 
 
310 aa  62.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  26.29 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  22.71 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  33.06 
 
 
314 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  32.11 
 
 
473 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 
352 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
317 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  30.49 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  31.11 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  31.58 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  27.34 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  22.76 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  37.21 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  31.58 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  31.58 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  31.58 
 
 
417 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  31.58 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  31.58 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  25.6 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  25.6 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  30.83 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  35.76 
 
 
314 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1043  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
333 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.791084  hitchhiker  0.00189554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  29.64 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  30.45 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  30.45 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  32.26 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  28.8 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>