278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3810 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
326 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  48.07 
 
 
316 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  47.37 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  41.56 
 
 
307 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  41.25 
 
 
307 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  40.31 
 
 
307 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 
307 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  44.91 
 
 
314 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  44.91 
 
 
314 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  43.21 
 
 
314 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  40 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 
304 aa  253  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 
307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  40.5 
 
 
307 aa  252  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  40 
 
 
307 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 
307 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 
307 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 
314 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  38.24 
 
 
308 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  38.24 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  39.57 
 
 
327 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  36.31 
 
 
313 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 
317 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  39.64 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  38.85 
 
 
314 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  38.85 
 
 
323 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  39.24 
 
 
313 aa  206  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  34.6 
 
 
310 aa  206  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  36.45 
 
 
312 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
310 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
311 aa  193  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
309 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  38.41 
 
 
324 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  37.99 
 
 
314 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 
314 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  35.42 
 
 
309 aa  183  3e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  34.26 
 
 
316 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  33.21 
 
 
301 aa  171  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
306 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  35.02 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  30.53 
 
 
308 aa  165  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  31.1 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  31.83 
 
 
310 aa  158  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
310 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
305 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
305 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  33.99 
 
 
334 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
298 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  27.18 
 
 
308 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  31.99 
 
 
274 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  24.62 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  28.27 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  28.27 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  28.27 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  28.26 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  28.26 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  23.91 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
276 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
281 aa  85.9  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  28.12 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
267 aa  84  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  31.03 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  31.03 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  31.03 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  26.93 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
302 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  27.56 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  28.15 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  27.01 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.68 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  24.4 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  25.36 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  22.15 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0801  Lysophospholipase-like protein  25.34 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  24.22 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  24.31 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  25.36 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  25.95 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>