89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2175 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
346 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  98.84 
 
 
346 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
346 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  85.55 
 
 
346 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  82.67 
 
 
352 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  80.39 
 
 
357 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  79.6 
 
 
348 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  66.98 
 
 
417 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  66.67 
 
 
336 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  66.05 
 
 
336 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  66.05 
 
 
336 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  66.05 
 
 
336 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  66.05 
 
 
336 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  66.99 
 
 
473 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  56.44 
 
 
302 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  55.78 
 
 
300 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  55.12 
 
 
314 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  55.12 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  52.46 
 
 
317 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  51.61 
 
 
303 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  50.32 
 
 
325 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  50.65 
 
 
325 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  44.84 
 
 
328 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  44.56 
 
 
327 aa  242  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  42.62 
 
 
300 aa  208  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  39.8 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  39.14 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  38.31 
 
 
305 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  39.32 
 
 
305 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  38.98 
 
 
305 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  38.98 
 
 
305 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  36.43 
 
 
298 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  32.63 
 
 
291 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  33.45 
 
 
291 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  36.19 
 
 
298 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  35.4 
 
 
295 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  35.4 
 
 
295 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  34.47 
 
 
300 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  36.57 
 
 
298 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  34.45 
 
 
301 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  34.25 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.38 
 
 
328 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  35.64 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  28.97 
 
 
296 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  33.97 
 
 
462 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  33.97 
 
 
293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  33.97 
 
 
293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  33.97 
 
 
293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  33.97 
 
 
293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  33.97 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  29.97 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  33.97 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  30.46 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  30.46 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  30.77 
 
 
330 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  30.72 
 
 
292 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  26.18 
 
 
321 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  25.55 
 
 
297 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  30.31 
 
 
289 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  31.95 
 
 
293 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  27.4 
 
 
287 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  24.81 
 
 
285 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
289 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  25.44 
 
 
288 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  31.39 
 
 
306 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  30.95 
 
 
294 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  31.19 
 
 
306 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  31.64 
 
 
291 aa  92.8  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  32 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  42.31 
 
 
104 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
288 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  27.17 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  27.91 
 
 
342 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  26.69 
 
 
329 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  27.81 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
317 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  28.05 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.23 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.17 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  28.68 
 
 
334 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  26.8 
 
 
342 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  32.04 
 
 
312 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>