99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00524 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  100 
 
 
288 aa  608  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  58.19 
 
 
287 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  49.63 
 
 
297 aa  295  8e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  48.97 
 
 
321 aa  292  5e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
289 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  35.77 
 
 
289 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  34.42 
 
 
291 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  30.11 
 
 
300 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  30.07 
 
 
305 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  29.72 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  29.68 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  29.68 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  29.68 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  27.68 
 
 
296 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  29.41 
 
 
305 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  28.89 
 
 
298 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  27.8 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  28.29 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  28.82 
 
 
301 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.06 
 
 
328 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  28.42 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  29.89 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  28.37 
 
 
294 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  26.91 
 
 
291 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 
462 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 
293 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  28.21 
 
 
293 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  28.21 
 
 
293 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  28.21 
 
 
293 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 
293 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  28.21 
 
 
295 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  28.16 
 
 
298 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  25.19 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  27.17 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  28.28 
 
 
312 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  27.57 
 
 
330 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  25.89 
 
 
327 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  27.6 
 
 
293 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  26.79 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  26.79 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  24.23 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  26.15 
 
 
328 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
317 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  31.42 
 
 
303 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  30 
 
 
325 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  27.38 
 
 
302 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
348 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  28.18 
 
 
306 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  28.18 
 
 
306 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  27 
 
 
314 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  29.62 
 
 
325 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  25.78 
 
 
346 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  25.69 
 
 
279 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  25.87 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  24.5 
 
 
346 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  25.44 
 
 
346 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  25.44 
 
 
346 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  27.3 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  27.3 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  24.48 
 
 
336 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  24.56 
 
 
357 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  24.73 
 
 
473 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  24.48 
 
 
417 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  24.14 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  24.14 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  24.14 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  24.14 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  25.26 
 
 
352 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
317 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  29.17 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  23.08 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
270 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  29.2 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  26.85 
 
 
310 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  31.78 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2835  hypothetical protein  32.14 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0510204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  26.85 
 
 
320 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  23.96 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
357 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
357 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.27 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  32.46 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  22.86 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  29.57 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  31.76 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  25.21 
 
 
279 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  34.29 
 
 
279 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>