89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1490 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
462 aa  872    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  99.66 
 
 
295 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
293 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  99.66 
 
 
293 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  99.66 
 
 
293 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  99.66 
 
 
293 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  99.66 
 
 
293 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  89.42 
 
 
293 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  36.43 
 
 
290 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  37.4 
 
 
298 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  39.46 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  34.9 
 
 
301 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  37.02 
 
 
305 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  35.29 
 
 
291 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  37.93 
 
 
305 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  37.37 
 
 
305 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  37.15 
 
 
295 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  37.1 
 
 
298 aa  137  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  37.15 
 
 
295 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  37.24 
 
 
305 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  37.24 
 
 
305 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  36.68 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  32.62 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  34.04 
 
 
291 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  35.49 
 
 
292 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  36.69 
 
 
328 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  34.18 
 
 
289 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  35.56 
 
 
300 aa  133  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  27.69 
 
 
285 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  30.13 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
289 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  130  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  35.36 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  31.15 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  35.02 
 
 
294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  37.1 
 
 
298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  33.21 
 
 
296 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
302 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  35.27 
 
 
327 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  35.36 
 
 
325 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  34.4 
 
 
291 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  33.98 
 
 
314 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  35.55 
 
 
302 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  34.56 
 
 
417 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  29.5 
 
 
321 aa  123  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  34.56 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  33.44 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  33.44 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  36.57 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  34.07 
 
 
473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  34.19 
 
 
336 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  34.19 
 
 
336 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  34.19 
 
 
336 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  34.19 
 
 
336 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  28.21 
 
 
288 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
300 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  34.47 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  34.47 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  31.98 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  27.44 
 
 
287 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  33.33 
 
 
330 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  34.49 
 
 
300 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  32.95 
 
 
346 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  33.92 
 
 
306 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 
357 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  33.57 
 
 
306 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  32.58 
 
 
352 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
348 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 
278 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
288 aa  61.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
334 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  28.46 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
301 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
317 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  30.51 
 
 
284 aa  53.5  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  23.68 
 
 
279 aa  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  40 
 
 
638 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.64 
 
 
652 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.64 
 
 
652 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  40 
 
 
638 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.64 
 
 
652 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.15 
 
 
318 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.82 
 
 
288 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  30.39 
 
 
277 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  31 
 
 
277 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  36.36 
 
 
451 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>