84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1464 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  685    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  38.67 
 
 
285 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  35.9 
 
 
291 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  35.9 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  32.73 
 
 
298 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  32.48 
 
 
300 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  32.47 
 
 
298 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  32.73 
 
 
298 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  33.46 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  33.86 
 
 
330 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  31.28 
 
 
321 aa  149  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  30.74 
 
 
305 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  30.58 
 
 
305 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  28.72 
 
 
346 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  30.28 
 
 
305 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  29.48 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  29.48 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  29.64 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  29.64 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  31.35 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  31.15 
 
 
462 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  33.2 
 
 
327 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  29.41 
 
 
473 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  28.57 
 
 
295 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  28.57 
 
 
295 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  28.06 
 
 
288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  31.15 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  31.15 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  31.15 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  31.15 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  31.15 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  31.15 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  28.85 
 
 
352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  29.84 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  29.3 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  32.41 
 
 
286 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 
289 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  28.1 
 
 
305 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  27.84 
 
 
287 aa  126  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  28.92 
 
 
325 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  30.83 
 
 
290 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  27.65 
 
 
325 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  30 
 
 
293 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  29.02 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  29.02 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  30.95 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  28.23 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  31.23 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  28.9 
 
 
336 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  28.9 
 
 
336 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  28.9 
 
 
336 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  28.9 
 
 
336 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  28.74 
 
 
314 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  26.48 
 
 
301 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  28.62 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  26 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
302 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  28.63 
 
 
302 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  30.29 
 
 
300 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
300 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  26.46 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  26.07 
 
 
306 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  27.17 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  27.17 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  23.24 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  23.08 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  20.39 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  22.5 
 
 
335 aa  46.2  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  25 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  23.73 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  22.46 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  21.07 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.75 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  23.61 
 
 
336 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>