81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1897 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  100 
 
 		 321 aa  671    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  67.57 
 
 		 297 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  50.53 
 
 		 287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  48.97 
 
 		 288 aa  292  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  33.83 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  32.28 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  31.09 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  30.77 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  31.28 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  31.48 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  33.89 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  29.34 
 
 		 285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  30.36 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  29.51 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  31.58 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  30.8 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  29.7 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  29.58 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  27.7 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  29.39 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  29.5 
 
 		 462 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  28.19 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  29.5 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  29.5 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  29.5 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  29.5 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  29.5 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  29.5 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  29.7 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  26.82 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  27.96 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  28.77 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  28.77 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  27.6 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  27.6 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  27.17 
 
 		 473 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  26.95 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  26.07 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  27.45 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  27.35 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  26.42 
 
 		 336 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  26.42 
 
 		 417 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  27.91 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  25.66 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  25.66 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  25.66 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  25.66 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  24.3 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  26.27 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  25.86 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  27.3 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  23.4 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  25.91 
 
 		 352 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  26.18 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  26.18 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  26.24 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  25.82 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  30.48 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  24.91 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  29.74 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  25.19 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  24.91 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  25.91 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  25.91 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  27.69 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  23.7 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  28.81 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  25.57 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>