115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0316 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 317 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  66.67 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  66.32 
 
 		 314 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  66.33 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  66.32 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  54.69 
 
 		 473 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  53.75 
 
 		 417 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  53.75 
 
 		 336 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  53.42 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  53.42 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  53.42 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  53.42 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  52.79 
 
 		 346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  53.18 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  53.18 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  52.94 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  52.43 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  50.61 
 
 		 357 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  50.79 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  51.18 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  50.33 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  50.16 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  46.69 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  45.54 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  40.56 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  39 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  39.39 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  37.45 
 
 		 300 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  39.46 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  39.26 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  38.59 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  38.59 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  37.58 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  36.05 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  35.06 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  39.85 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  35 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  38.99 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  38.99 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  34 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  36.8 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  30.49 
 
 		 328 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  31.02 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  28.24 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  31.02 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  31.6 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  31.6 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  31.6 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  31.6 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  31.6 
 
 		 293 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  31.86 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  31.63 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  27.14 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  31.16 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  31.42 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  31.42 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  29.66 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  29.45 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  25.4 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  26.36 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  32.83 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  30.29 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  24.61 
 
 		 287 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  49.5 
 
 		 104 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  28.63 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  29.56 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  30.58 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  29.67 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  27.78 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  25.62 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  34 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  33.33 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  25.65 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  30.53 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1988  hypothetical protein  23.47 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  27.97 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  31.73 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  27.34 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 317 aa  45.8  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  31.39 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  27.18 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  27.18 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  25.38 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.08 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  31.52 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>