114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2936 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
317 aa  621  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 
334 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  36.86 
 
 
284 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
301 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 
278 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  30.8 
 
 
308 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
279 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  31.44 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  32.9 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  28.41 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  30.08 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  28.74 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  29.92 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  28.62 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  25.8 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  29.3 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  30.16 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  30.5 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  29.96 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  29.37 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  31.36 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  30.2 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  29.8 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  29.6 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  29.6 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  26.85 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  29.88 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  28.31 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  26.21 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  26.21 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  28 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  28 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  28 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  28.27 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  28.06 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  29.08 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  30.07 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  28.09 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  23.81 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  29.36 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  26.94 
 
 
301 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  26.32 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  26.32 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  26.32 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  26.32 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  27.34 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
462 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  26.51 
 
 
473 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  29.5 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  23.24 
 
 
297 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2083  lipase, putative  28.78 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.826703  normal  0.0145598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  25.51 
 
 
288 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  29.12 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  26.1 
 
 
417 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  26.1 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  27.99 
 
 
306 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  25.7 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  25.7 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  25.7 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  25.7 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  30.08 
 
 
342 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  21.21 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  25.28 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  27.07 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  26.21 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  28.74 
 
 
294 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  26.42 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  27.31 
 
 
342 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  24.51 
 
 
286 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  27.71 
 
 
290 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00134  hypothetical protein  31.43 
 
 
139 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  23.79 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  23.27 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  30.3 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  32.76 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.75 
 
 
250 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  44.64 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.15 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  30.09 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.73 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>