78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1504 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  35.48 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
301 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
317 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00134  hypothetical protein  43.55 
 
 
139 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
334 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  29.89 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  31.67 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  29.04 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  30.08 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  29.75 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  28.69 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  26.88 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  26.88 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  27.62 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  26.88 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  26.88 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  26.88 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  30.1 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 
462 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  28.45 
 
 
298 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  28.12 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  23.08 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00133  hypothetical protein  63.16 
 
 
44 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  26.8 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  29.46 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  28.51 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  28.12 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  23.6 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  30.1 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  29.06 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  26.12 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  29.59 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  27.86 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  26.12 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1860  Alpha/beta hydrolase  35.25 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  25.6 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  22.73 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0084  PHA synthase subunit PhaC  42.11 
 
 
356 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  28.63 
 
 
306 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  28.43 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  27.82 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  22.46 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  26.36 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  28.78 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  28.78 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  28.78 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  29.38 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  24.4 
 
 
336 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  24.4 
 
 
417 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  24.8 
 
 
336 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  24.8 
 
 
336 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  29.24 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  24.8 
 
 
336 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  24.8 
 
 
336 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  29.24 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  24.38 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  26.74 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
325 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
288 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
281 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>