123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1678 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  83.04 
 
 		 288 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  48.57 
 
 		 278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 		 317 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  41.31 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  35.48 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  30.61 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  31.15 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  32.72 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  31.15 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  30.71 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  32.08 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  34.3 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  32.38 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  28.04 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  31.36 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  31.69 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  31.37 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  30.4 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  30.4 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  30.17 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  31.25 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  23.48 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  32.38 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  29.03 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  31.56 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  31.72 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  28.77 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  28.77 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  28.77 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  28.77 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  30.6 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  28.77 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  31.02 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  31.02 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  25.42 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  26.62 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  29.67 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  27.59 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  31.85 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  27.17 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  27.17 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  27.17 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  27.17 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  27.17 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  23.08 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  27.17 
 
 		 417 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  27.45 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  34.92 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  41.8 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  31.79 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.45 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  29.03 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  29.03 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  27.02 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0328  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  31.46 
 
 		 289 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  25.28 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  27.17 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  26.84 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  27.17 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  26 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  23.7 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 330 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  27.66 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  31.78 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  26.45 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  30.36 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  26.36 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 		 320 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  26.81 
 
 		 352 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  27.24 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  39.17 
 
 		 494 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  25.55 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>