103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1984 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 327 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  71.38 
 
 		 328 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  49.14 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  49.82 
 
 		 314 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  45.58 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  45.45 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  45.45 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  45.45 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  45.45 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  47.33 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  45.1 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  47.57 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  45.1 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  44.56 
 
 		 346 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  44.56 
 
 		 346 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 348 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  44.56 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  43.62 
 
 		 473 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  45.61 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  44.07 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  49.62 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  44.37 
 
 		 325 aa  226  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  44.3 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  35.04 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  39.45 
 
 		 305 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  38.54 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  37.93 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  38.38 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  38.7 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  35.22 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  37.8 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  37.8 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  35.82 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  37.28 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  37.28 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  35.27 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  35.27 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  35.27 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  35.27 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  35.27 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  35.19 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  34.62 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  35.27 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  36.8 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  33.2 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  34.84 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  33.22 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  33.73 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  33.22 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  26.87 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  31.78 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  26.88 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  37.2 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  32.6 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  33.22 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  35.8 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  26.91 
 
 		 285 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 289 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  25.89 
 
 		 288 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  27.45 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  33.61 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  32.87 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  32.31 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  32.31 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  33.2 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  32.11 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  32 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  46.39 
 
 		 104 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  31.37 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  33.64 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  33.64 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  29.82 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.62 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  37.31 
 
 		 267 aa  46.2  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  23.66 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  31.18 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  33.03 
 
 		 615 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  29.91 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  31.91 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  36.56 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  36.84 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  26.4 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  30.68 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>