49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1450 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 104 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  88.78 
 
 		 325 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  87.76 
 
 		 325 aa  174  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  70.41 
 
 		 303 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  53.06 
 
 		 314 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  52.04 
 
 		 302 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  49.5 
 
 		 317 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  53.26 
 
 		 300 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  48.98 
 
 		 302 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  45.19 
 
 		 348 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  47.12 
 
 		 346 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  45.19 
 
 		 352 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  45.19 
 
 		 357 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  46.39 
 
 		 327 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  44.79 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  42.31 
 
 		 346 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  47.47 
 
 		 473 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  42.31 
 
 		 346 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  42.31 
 
 		 346 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  45.45 
 
 		 336 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  45.45 
 
 		 417 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  45.92 
 
 		 336 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  45.92 
 
 		 336 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  45.92 
 
 		 336 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  45.92 
 
 		 336 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  42.16 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  37.76 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  31 
 
 		 291 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  32 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  34.04 
 
 		 300 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  38.2 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  37.78 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  37.78 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  38.2 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  37.78 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  37.08 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  32.26 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  32.26 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  33.33 
 
 		 330 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  34.02 
 
 		 291 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  39.02 
 
 		 290 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  39.02 
 
 		 290 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  31.91 
 
 		 293 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  31.91 
 
 		 462 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  31.91 
 
 		 293 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  31.91 
 
 		 293 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  31.91 
 
 		 293 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  31.91 
 
 		 293 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  31.91 
 
 		 295 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>