81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1964 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  37.5 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  33.58 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  30.82 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  36.14 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  34.98 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  30.53 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  31.4 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  32.95 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  33.46 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  33.2 
 
 		 325 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  26.91 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  33.58 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  33.6 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  30.77 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  33.6 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  34.01 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  34.98 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  31.78 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  33.2 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  33.2 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  33.2 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  33.2 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  31.98 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  31.98 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  31.98 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  31.98 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  31.98 
 
 		 462 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  31.98 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  29.28 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  31.98 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  34.47 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  32.08 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  31.58 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  26.89 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  31.28 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  27.35 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  27.45 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  31.33 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  30.6 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  33.88 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  26.92 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  30.45 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  33.09 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  24.8 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  30 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  32.03 
 
 		 346 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 348 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  31.64 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  28.92 
 
 		 473 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  31.64 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  29.22 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  30.77 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  28.81 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  29.27 
 
 		 352 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  29.75 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  29.66 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  29.92 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  30.36 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  30.36 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  26.64 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  28.51 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.4 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 334 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>