91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2916 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  99.4 
 
 
336 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  99.11 
 
 
417 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  90.15 
 
 
473 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  68.1 
 
 
352 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  70.03 
 
 
346 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  66.67 
 
 
357 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  69.38 
 
 
348 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  65.43 
 
 
346 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  65.94 
 
 
346 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  65.94 
 
 
346 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  56.77 
 
 
300 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  55.78 
 
 
302 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  53.42 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  55.45 
 
 
314 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  55.45 
 
 
302 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  50.97 
 
 
303 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  51.48 
 
 
325 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  50.98 
 
 
325 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  44 
 
 
328 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  45.45 
 
 
327 aa  245  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  43.92 
 
 
300 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  37.99 
 
 
305 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  37.99 
 
 
305 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  34.62 
 
 
305 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  35.58 
 
 
305 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  35.58 
 
 
305 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  35.58 
 
 
305 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  33.97 
 
 
291 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  32.17 
 
 
291 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  35.59 
 
 
295 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  35.59 
 
 
295 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  35.45 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  36.69 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  34.53 
 
 
301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  37.05 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  32.99 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  33.94 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  33.8 
 
 
295 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  33.8 
 
 
293 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  33.8 
 
 
293 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  33.8 
 
 
293 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  33.8 
 
 
293 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  33.8 
 
 
293 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  33.8 
 
 
462 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  33.45 
 
 
290 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  31.18 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  30.96 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.9 
 
 
328 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  30.88 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  26.55 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  33.46 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  31.4 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  26.03 
 
 
285 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  25.66 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  29.33 
 
 
289 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
289 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  30 
 
 
291 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  28.52 
 
 
290 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  28.52 
 
 
290 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  27.34 
 
 
287 aa  95.9  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  28.05 
 
 
330 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  24.14 
 
 
288 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  30.5 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  29.55 
 
 
306 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  45.92 
 
 
104 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  29.64 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  27.17 
 
 
284 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  26.32 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3657  hypothetical protein  26.23 
 
 
342 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.186916  normal  0.561219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
311 aa  46.2  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  26.3 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  25.74 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  29.13 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43400  predicted protein  33.8 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.21528  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  30 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  35.92 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  24.8 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  23.72 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  21.48 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
274 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>