93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2996 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  100 
 
 		 306 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  97.39 
 
 		 306 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  34.87 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  35.2 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  33.55 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  33.55 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  34.21 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  32.89 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  33.92 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  33.92 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  34.9 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  29.45 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  35.02 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  28.18 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  29.74 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  31.82 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  31.27 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  30.29 
 
 		 328 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  32.62 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  31.29 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  26.46 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  26.15 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  28.62 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  35.12 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  32 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  31.39 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  31.58 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  31.05 
 
 		 346 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  31.05 
 
 		 346 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  29.26 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  29.26 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  29.86 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  29 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  29.55 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  29.55 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  28.97 
 
 		 300 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  29.55 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  29.55 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  29.55 
 
 		 336 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  29.79 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  27.95 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  30.5 
 
 		 473 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  27.72 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  29.29 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  28.36 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  31.69 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  31.58 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  27.87 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  30.45 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  30.13 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  30.39 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  29.39 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  29.64 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  27.53 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  22.79 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  29.92 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  28.63 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  24.39 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  31.85 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  26.48 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.41 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.25 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  34.4 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  34.4 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  27.82 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.34 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  32.37 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.03 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2223  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  34.4 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4256  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  35.2 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  35.2 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0327  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0162  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>