37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0162 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0162  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
278 aa  564  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0327  alpha/beta hydrolase fold protein  86.33 
 
 
278 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0164  alpha/beta hydrolase fold  42.29 
 
 
303 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  35.79 
 
 
284 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0328  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
284 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1232  hypothetical protein  29.68 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.428438  normal  0.185348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0964  putative esterase/hydrolase  27.81 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1733  putative esterase/hydrolase  27.84 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0093  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  22.53 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
269 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  32.62 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  27.35 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  25.78 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  24.92 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
278 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  42.68 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
273 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  25.66 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  22.17 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  26.74 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.2 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  27.78 
 
 
316 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  33.33 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>