36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1232 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1232  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.428438  normal  0.185348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0162  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0327  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0164  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 303 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  29.71 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  34.47 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  36.22 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  29.55 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  27.5 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0093  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  29.32 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1733  putative esterase/hydrolase  26.67 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  23.21 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3309  alpha/beta hydrolase fold protein-1  33.91 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  34.35 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  27.06 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3125  Alpha/beta hydrolase fold-1  46.38 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0964  putative esterase/hydrolase  33.58 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.45 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  25.58 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.98 
 
 		 434 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 379 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>