86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0964 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0964  putative esterase/hydrolase  100 
 
 
297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1733  putative esterase/hydrolase  34.06 
 
 
295 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0162  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  32.29 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  31.91 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0164  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5301  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411454  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  27.44 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0327  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  30.03 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  29.58 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  29.58 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  33.81 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.78 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0093  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  31.12 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3309  alpha/beta hydrolase fold protein-1  30.85 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1407  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 
252 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.29 
 
 
262 aa  52.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
302 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 
265 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  25.17 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3034  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
264 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 
278 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
284 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1562  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424412  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2177  hypothetical protein  29.69 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.362241  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  24.82 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5036  alpha/beta hydrolase fold-1  37.16 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
239 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  33.99 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  37.74 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  27.41 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 
233 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  41.72 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
351 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.3 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  28.7 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6963  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 
282 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  28.7 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
268 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  28.7 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
321 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
276 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>