249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4917 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  100 
 
 		 272 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  38.06 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1407  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  31.94 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  33.88 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.43 
 
 		 434 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  33.33 
 
 		 296 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2177  hypothetical protein  40.32 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.362241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  31.7 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  30.08 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  50 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3034  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3108  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161436  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5301  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0964  putative esterase/hydrolase  30.03 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  25.94 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3309  alpha/beta hydrolase fold protein-1  34.05 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5036  alpha/beta hydrolase fold-1  41.53 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  29.52 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0162  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5930  hypothetical protein  28.68 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  40.35 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0093  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3125  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.87 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  27.5 
 
 		 363 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  41.12 
 
 		 543 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  32.56 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0327  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  25.88 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  35.61 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  25.29 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.21 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4392  putative dioxygenase  37.21 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537049  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2175  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 338 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  30.63 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  29.73 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 317 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  25.37 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  21.93 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2082  hypothetical protein  28.7 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  36.27 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  30.77 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2026  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.71 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  37.23 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  37.33 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  22.02 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  23.81 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 		 592 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>