263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1407 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1407  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  53.64 
 
 
263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  48.11 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  44.7 
 
 
265 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  46.24 
 
 
267 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  45.04 
 
 
271 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  43.58 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3034  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 
266 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  44.94 
 
 
284 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3309  alpha/beta hydrolase fold protein-1  43.92 
 
 
267 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3108  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 
280 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161436  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
278 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5301  alpha/beta hydrolase fold  45.17 
 
 
275 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5036  alpha/beta hydrolase fold-1  39.46 
 
 
251 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  42.48 
 
 
278 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  42.08 
 
 
268 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.08 
 
 
434 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2177  hypothetical protein  40.53 
 
 
258 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.362241  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  37.22 
 
 
270 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3125  Alpha/beta hydrolase fold-1  47.67 
 
 
277 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2082  hypothetical protein  40 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 
291 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  34.46 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
252 aa  99.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1733  putative esterase/hydrolase  24.39 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  23.62 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5930  hypothetical protein  28.57 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.615231  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  25.97 
 
 
219 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0164  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
303 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.46 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
284 aa  62  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0093  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  24.73 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0964  putative esterase/hydrolase  27.37 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0163  hypothetical protein  30.34 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  31.82 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.79 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2175  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
361 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  30.91 
 
 
264 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  26.42 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
363 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  29.85 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
274 aa  52.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 
543 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
293 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.02 
 
 
265 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
323 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.82 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3694  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  36.19 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
286 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  22.18 
 
 
283 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  27.42 
 
 
256 aa  48.9  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 
259 aa  48.9  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
292 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
274 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  27.15 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  23.16 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  29.61 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>