More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5645 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2929  putative alpha/beta hydrolase  33.07 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0296814 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1055  alpha/beta hydrolase  32.81 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.76 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 269 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  28.95 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  28.79 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  29.28 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  26.72 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 387 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  30.91 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.14 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  26.51 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  22.91 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  27.61 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  22.51 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  23.93 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.85 
 
 		 371 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  26.67 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  26.2 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  27.07 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.44 
 
 		 371 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.44 
 
 		 371 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38590  hypothetical protein  28 
 
 		 154 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  28.5 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  28.22 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 431 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>