More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5137 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
315 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.19 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  24.81 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  22.11 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  27.08 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  30 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  29.2 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  25.33 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  25 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  23.67 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  20.88 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4805  prolyl aminopeptidase  27.27 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.29 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.5 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  26.33 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  23.79 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  25 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
295 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  25.25 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  23.55 
 
 
269 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  25.97 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  26.04 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.47 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  26.64 
 
 
302 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
263 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 
264 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
254 aa  63.2  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
273 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  25.47 
 
 
263 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  27.18 
 
 
266 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4784  prolyl aminopeptidase  27.27 
 
 
286 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 
309 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  27.21 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  21.95 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0460  proline iminopeptidase  26.13 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  23.51 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 
270 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  26.41 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  26.88 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
265 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.12 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
340 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1019  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.154023  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.9 
 
 
265 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  22.41 
 
 
279 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
266 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 
281 aa  60.1  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
290 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 
270 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4497  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
287 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
285 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.42 
 
 
257 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 
273 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
274 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.59 
 
 
279 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.38 
 
 
270 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
259 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 
276 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  19.93 
 
 
263 aa  59.3  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3507  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.973845  normal  0.812562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  26.13 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4398  hydrolase; prolyl aminopeptidase  26.6 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  24.83 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>