More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0559 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0559  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  565  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.881778  normal  0.0430295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 
286 aa  178  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 
284 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
283 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
304 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  23.96 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.43 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 
319 aa  82  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  36.28 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  24.31 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  22.7 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  23.65 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.76 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  22.56 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  21.62 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.76 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  24.28 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  21.32 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.31 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  26.27 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  31.71 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  23.71 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.89 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  28.8 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  25.09 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  20.64 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
284 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  23.28 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  25.42 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  22.83 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  22.11 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  24.05 
 
 
259 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  23.83 
 
 
425 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
264 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  23.6 
 
 
263 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
280 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  27.11 
 
 
259 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  23.39 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 
356 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  21.67 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  23.74 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  25.95 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
302 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.33 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  24.78 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  25.86 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>