More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1168 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
286 aa  593  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  66.91 
 
 
285 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  66.08 
 
 
281 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  57.69 
 
 
279 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  49.3 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 
278 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  46.55 
 
 
298 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  42.21 
 
 
277 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  44.25 
 
 
284 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  44.79 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  40.49 
 
 
284 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  40.86 
 
 
322 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  40.99 
 
 
282 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  40.21 
 
 
278 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
280 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  38.89 
 
 
286 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.3 
 
 
285 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  37.46 
 
 
314 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
287 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 
289 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  35.21 
 
 
286 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
271 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
271 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
271 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.32 
 
 
295 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28.21 
 
 
277 aa  109  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
274 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
331 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
275 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
284 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  28.31 
 
 
287 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  27.57 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  27.57 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  28.31 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  28.31 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  28.31 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  27.21 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  27.57 
 
 
356 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
265 aa  89.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.19 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  27.21 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  29.09 
 
 
306 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.23 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.73 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5047  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.33 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  27.46 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  25.97 
 
 
330 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5568  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  24.65 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.07 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  26.67 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.03 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  24.71 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  25.74 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  25.74 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  27.03 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.8 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0707  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>