More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2213 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  41.45 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4538  alpha/beta hydrolase fold protein  44 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  hitchhiker  0.00753494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  43.43 
 
 		 277 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0550  alpha/beta family hydrolase  41.09 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4123  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1168  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  39.44 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.84 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  35.97 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  35.46 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  36.1 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2018  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 279 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  33.7 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.34 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5181  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.941772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  25.85 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.36 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  22.93 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  24.56 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  22.61 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  25.19 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  23.38 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.3 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  24.18 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  25.62 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  22.98 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.39 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  23.1 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  25.09 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  23.1 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  24.2 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  22.92 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  22.61 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>