213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2177 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2177  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.362241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  47.29 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  44.7 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2996  alpha/beta hydrolase fold-1  45.14 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4134  hydrolase  43.73 
 
 		 296 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205573  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  42.15 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4939  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 278 aa  164  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  43.89 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  41.7 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5301  alpha/beta hydrolase fold  46.94 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3034  alpha/beta hydrolase fold  41.83 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1407  alpha/beta hydrolase fold protein  40.53 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1116  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.46 
 
 		 434 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0320317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  43.98 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.120461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5036  alpha/beta hydrolase fold-1  41.37 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3108  alpha/beta hydrolase fold  39.54 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161436  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3125  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.36 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3309  alpha/beta hydrolase fold protein-1  35.43 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1740  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4917  putative hydrolase  33.59 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2082  hypothetical protein  38.95 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1733  putative esterase/hydrolase  29.79 
 
 		 295 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0224945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  38.73 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2097  hydrolase  26.79 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 300 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  34.26 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.37 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  44.94 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  30.56 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.76 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 		 372 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.86 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 350 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  27.56 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  24.91 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 543 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 340 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  25.28 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  37.74 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  35.96 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 		 397 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 338 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  37.23 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  37.74 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  32.29 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  23.99 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.73 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.63 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.25 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.62 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1114  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0902731  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0964  putative esterase/hydrolase  29.41 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2130  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0093  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>