More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1562 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1562  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 281 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424412  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4947  putative hydrolase  55.8 
 
 		 283 aa  265  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5099  alpha/beta hydrolase fold protein  48.74 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3267  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.439503  hitchhiker  0.00517721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6037  hypothetical protein  42.59 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2980  alpha/beta hydrolase fold protein  40.42 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1268  hypothetical protein  39.73 
 
 		 290 aa  165  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0354701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4785  alpha/beta hydrolase fold protein  38.01 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6963  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  37.99 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3694  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  36.14 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0121  hypothetical protein  38.91 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0153  hydrolase  35.38 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0155  alpha/beta fold family hydrolase  35.38 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0161  hypothetical protein  35.38 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0160  hypothetical protein  35.38 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0182  hypothetical protein  35.38 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0204  hypothetical protein  35.38 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0078  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  33.95 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  37.7 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  33.33 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  40.17 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  39.8 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  32.5 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  34.51 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8373  proline iminopeptidase  37.7 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  29.38 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  31.3 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  30.36 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  33.63 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.29 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.32 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.79 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  29.2 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  34.71 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.82 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  35.25 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>