93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2079 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  44.14 
 
 
305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  44.33 
 
 
305 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  44.33 
 
 
305 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  43.79 
 
 
305 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  44.33 
 
 
305 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  43.64 
 
 
305 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  41.05 
 
 
295 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  41.05 
 
 
295 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  41 
 
 
312 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  35.74 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  37.76 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  37.88 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  37.46 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  36.03 
 
 
292 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  37.63 
 
 
314 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  38.13 
 
 
294 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 
300 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
302 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  37.1 
 
 
291 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  35.18 
 
 
473 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  37.55 
 
 
298 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  34.9 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  34.9 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  34.9 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  34.9 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  34.9 
 
 
295 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  34.9 
 
 
293 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  34.9 
 
 
462 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  34.85 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  34.85 
 
 
417 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  36.79 
 
 
300 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  35.23 
 
 
293 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  35.52 
 
 
290 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  35.52 
 
 
290 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  34.53 
 
 
336 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 
348 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  34.53 
 
 
336 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  34.53 
 
 
336 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  34.53 
 
 
336 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  34.09 
 
 
346 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 
325 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  35.02 
 
 
346 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  34.22 
 
 
346 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  34.22 
 
 
346 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  32.89 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  33.98 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  31.38 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  28.87 
 
 
288 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  33.55 
 
 
357 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  34.97 
 
 
325 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  36.04 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  34.84 
 
 
327 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  29.35 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  34.26 
 
 
328 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  30.63 
 
 
297 aa  132  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  36.4 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  31.14 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  33.81 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 
289 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  31.41 
 
 
296 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  28.57 
 
 
285 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.74 
 
 
328 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  33.78 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  33.09 
 
 
291 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  31.45 
 
 
330 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  28.99 
 
 
306 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  28.66 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  28.67 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  30.12 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
334 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1956  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  30.06 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  24.2 
 
 
402 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  32.67 
 
 
580 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 
374 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  32.28 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  41.79 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  36.07 
 
 
442 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.14 
 
 
285 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  29.86 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.05 
 
 
656 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  31.2 
 
 
259 aa  42.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  33.04 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.89 
 
 
600 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  26.63 
 
 
405 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>