77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0288 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  38.79 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  37.72 
 
 		 305 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  37.72 
 
 		 305 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  39.29 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  39.29 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  37.72 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  36.17 
 
 		 295 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  36.17 
 
 		 295 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  35.23 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  32.77 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  35.4 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  35.48 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  32.07 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  32.07 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  32.07 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  32.07 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  32.07 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  34.46 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  31.85 
 
 		 462 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  32.07 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  33.9 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  32.62 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  37.76 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  30.92 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  32.41 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  33.79 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  30.46 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  33.45 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  30.46 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  30.46 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  32.31 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  32.16 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  31.1 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  29.04 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  30.46 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  29.24 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  28.95 
 
 		 357 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  28.77 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  33.33 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  28.86 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  28.86 
 
 		 417 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  28.52 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  28.52 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  28.52 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  28.52 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  27.3 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  31.5 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  30.03 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  29.63 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  33.73 
 
 		 298 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  28.37 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  29.26 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  31.37 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  25.93 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  27.5 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  28.18 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  30.74 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  25.91 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  30 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  27.17 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  30.4 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  30.36 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  29.41 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  23.84 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  23.15 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  30.56 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  30.56 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>