96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3679 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
279 aa  559  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  34.1 
 
 
278 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
317 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
334 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  30.62 
 
 
284 aa  89  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  25.88 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  27.54 
 
 
305 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  23.53 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  23.53 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 
462 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  23.53 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  23.53 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  25.37 
 
 
291 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  23.57 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  22.62 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  20.39 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  25.79 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  26.12 
 
 
279 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.54 
 
 
357 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  27.36 
 
 
305 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  29.17 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  26.37 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  25.5 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  27.27 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  27.27 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  27.45 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
335 aa  50.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  26.47 
 
 
277 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  22.92 
 
 
308 aa  49.3  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
267 aa  48.9  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  26.67 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2809  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  24.89 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  26.47 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  29.32 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  23.9 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  18.89 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  28.1 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
357 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
357 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  30.08 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  27.27 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  29.31 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  21.43 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1771  lipase, putative  24.48 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783432  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  27.27 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.75 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  25.87 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  23.56 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  23.57 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  23.15 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  21.31 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  25 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  25 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  23.15 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  21.01 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  25.43 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3696  alpha/beta hydrolase  26.23 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2293  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.82 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00953151  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  30.94 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
305 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  31.65 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
305 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  25.09 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1594  alpha/beta fold family hydrolase  27.64 
 
 
342 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0477038 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  22.58 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  20.25 
 
 
317 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  23.13 
 
 
308 aa  43.1  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 
364 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  24.06 
 
 
297 aa  42.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
320 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
314 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
368 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  23.44 
 
 
287 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  30.23 
 
 
327 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
337 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>