82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0686 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  62.86 
 
 
290 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  59.39 
 
 
292 aa  329  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  51.09 
 
 
294 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  36.36 
 
 
305 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  36.01 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  35.74 
 
 
305 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  36.1 
 
 
305 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  35.74 
 
 
305 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  35.02 
 
 
305 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  35.13 
 
 
295 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  35.13 
 
 
295 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  33.96 
 
 
291 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  35.74 
 
 
301 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  34.39 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  31.77 
 
 
296 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  30.96 
 
 
297 aa  146  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  32.62 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  32.62 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  32.62 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  32.62 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  32.62 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  30.36 
 
 
321 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  32.62 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  32.62 
 
 
462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  32.52 
 
 
312 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  29.63 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  33.82 
 
 
328 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  30.6 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  29.89 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  32.41 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  32.03 
 
 
473 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  31.52 
 
 
298 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  33.73 
 
 
327 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  31.32 
 
 
336 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  31.32 
 
 
417 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  30.5 
 
 
300 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  32.62 
 
 
290 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  32.62 
 
 
290 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  30.66 
 
 
346 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  30.96 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  30.96 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  30.96 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  30.96 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  27.94 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  31.76 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  29.71 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  30.74 
 
 
298 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  29.97 
 
 
346 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  29.97 
 
 
346 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  29.97 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  30.31 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  30.1 
 
 
357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  29.86 
 
 
352 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  29.46 
 
 
300 aa  112  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
300 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  30.42 
 
 
303 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  31.13 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  30.89 
 
 
325 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 
325 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  29.82 
 
 
330 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  27.23 
 
 
285 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  28.12 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  28.62 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  26.69 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  23.48 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  24.72 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.2 
 
 
364 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  28.91 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
348 aa  46.2  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  35.53 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  27.54 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
334 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  20.69 
 
 
348 aa  42.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>