97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3462 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  100 
 
 
291 aa  587  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  88.66 
 
 
291 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  51.82 
 
 
298 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  44.32 
 
 
285 aa  258  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  47.37 
 
 
300 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  47.31 
 
 
298 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  47.69 
 
 
298 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  41.43 
 
 
330 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  35.9 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  38.06 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  38.06 
 
 
325 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  37.11 
 
 
303 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  33.45 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  35.98 
 
 
473 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  36.99 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  35.04 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  33.58 
 
 
328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  34.35 
 
 
417 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  34.35 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  37.97 
 
 
290 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  36.99 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  37.77 
 
 
294 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  31.09 
 
 
321 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  33.97 
 
 
336 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  33.97 
 
 
336 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  33.97 
 
 
336 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  33.97 
 
 
336 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  36.4 
 
 
312 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  36.64 
 
 
292 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  35.52 
 
 
357 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  33.96 
 
 
286 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 
348 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
317 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  37.46 
 
 
301 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  33.84 
 
 
296 aa  153  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
300 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  34.85 
 
 
305 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  34.47 
 
 
305 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  34.07 
 
 
346 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  33.45 
 
 
346 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  34.62 
 
 
352 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  33.45 
 
 
346 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  33.09 
 
 
346 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  34.47 
 
 
305 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  34.47 
 
 
305 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  34.09 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  32.95 
 
 
305 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  34.66 
 
 
295 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  34.66 
 
 
295 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  35.61 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  35.61 
 
 
462 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  35.61 
 
 
293 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  35.61 
 
 
293 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  35.61 
 
 
293 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  35.61 
 
 
293 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  35.61 
 
 
293 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  32.82 
 
 
300 aa  138  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  30.38 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  30.53 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
289 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  32.61 
 
 
289 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  32.95 
 
 
293 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  25.19 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  31.01 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  31.5 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  31.5 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  27.97 
 
 
306 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
317 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  30.61 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  27.87 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  31.67 
 
 
308 aa  82  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  31 
 
 
104 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  32.52 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  28.93 
 
 
397 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.02 
 
 
357 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  35.79 
 
 
320 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  23.93 
 
 
310 aa  45.8  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  29.11 
 
 
334 aa  45.8  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  40.85 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  35.04 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  26.6 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  23.29 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  25.53 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  37.97 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  25.41 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
256 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
357 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  28.43 
 
 
348 aa  42.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>