99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  100 
 
 
291 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  88.66 
 
 
291 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  52.57 
 
 
298 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  44.69 
 
 
285 aa  255  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  48.5 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  49.04 
 
 
298 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  49.43 
 
 
298 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  43.12 
 
 
330 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  35.9 
 
 
328 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  35.89 
 
 
325 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  34.15 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
302 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  35.14 
 
 
302 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  35.51 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  33.57 
 
 
328 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  33.57 
 
 
352 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  38.26 
 
 
294 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  30.77 
 
 
321 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  37.55 
 
 
292 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  35.89 
 
 
325 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  32.52 
 
 
336 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  32.52 
 
 
417 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  32.63 
 
 
346 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  32.63 
 
 
346 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  32.17 
 
 
336 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  32.17 
 
 
336 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  32.17 
 
 
336 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  32.17 
 
 
336 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  33.57 
 
 
346 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  32.63 
 
 
346 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  35.22 
 
 
327 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  35.64 
 
 
305 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  36.9 
 
 
290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
317 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  35.27 
 
 
305 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  35.23 
 
 
296 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  33.86 
 
 
297 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  33.22 
 
 
473 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  36.33 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
300 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  34.39 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  35.74 
 
 
295 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  37.1 
 
 
301 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  35.74 
 
 
295 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  33.94 
 
 
305 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  34.42 
 
 
305 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  34.42 
 
 
305 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  34.42 
 
 
305 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  30.82 
 
 
291 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  29.92 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  34.84 
 
 
462 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  34.44 
 
 
293 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  34.44 
 
 
293 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  34.44 
 
 
293 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  34.44 
 
 
295 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  34.44 
 
 
293 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  34.44 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  30.89 
 
 
300 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  31.88 
 
 
289 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  32.3 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  24.23 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  32.66 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  30.23 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  31.37 
 
 
290 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  31.37 
 
 
290 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
317 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  29.89 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  30.71 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  25.44 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
301 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  24.39 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  32 
 
 
104 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  25 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  34.86 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  27.03 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  23.9 
 
 
279 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4247  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.15 
 
 
357 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.724002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  26.04 
 
 
277 aa  45.8  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4403  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.956683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  25.41 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4396  alpha/beta hydrolase fold  25.12 
 
 
368 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375375 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  27.94 
 
 
546 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  26.8 
 
 
397 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  24.48 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4380  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
357 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  29.79 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  29.03 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  30.51 
 
 
259 aa  42.4  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>