137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1672 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
288 aa  573  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  83.04 
 
 
284 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  47.14 
 
 
278 aa  228  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  44.02 
 
 
301 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 
317 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 
334 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  36.21 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  35.77 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  33.21 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  34.29 
 
 
298 aa  89  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  31.95 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  28.73 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  31.51 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  34.29 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  29.84 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  31.05 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  25.29 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  29.15 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  29.46 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  28.29 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  29.15 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  31.22 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  27.41 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  27.41 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  27.41 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  27.41 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  29.56 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  27.41 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  27.41 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  33.33 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  27.41 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  33.33 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  32.91 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  32.91 
 
 
305 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  26.16 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  22.26 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  28.73 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  24.12 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  30.3 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  27.69 
 
 
346 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  29.66 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  29.49 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  29.49 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  28.67 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  28.67 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  26.72 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  27.53 
 
 
346 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  27.53 
 
 
346 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
348 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  25.48 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  27.53 
 
 
346 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  25.48 
 
 
417 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
345 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  26.32 
 
 
357 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  36.79 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  25.1 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  25.77 
 
 
473 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  25.1 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  25.1 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  25.1 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  27.53 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  27.53 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  30.43 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  24.37 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  35.09 
 
 
291 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2319  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.201486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
289 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  36.11 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  26.29 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  27.59 
 
 
308 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  24.79 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
310 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  36.84 
 
 
287 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
278 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
346 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  26.92 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  28.02 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  28.57 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  22.88 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>