139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2319 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2319  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  658    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.201486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1467  lysophospholipase-like protein  43.92 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4954  lysophospholipase-like protein  40.47 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696084  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2069  lysophospholipase-like protein  35.58 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4523  hypothetical protein  32.17 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2466  lysophospholipase-like protein  36.59 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.876746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5135  lysophospholipase-like protein  39.87 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5224  lysophospholipase-like protein  39.87 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5516  lysophospholipase-like protein  39.87 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1273  alpha/beta hydrolase fold protein  39.18 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4374  lysophospholipase-like  33.75 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.501415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  23.81 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  22 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02800  lysophospholipase  25.28 
 
 		 426 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  31.96 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  35 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  22.8 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.02 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  22 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  22.4 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  22.4 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.58 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  22 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  22.4 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  37.08 
 
 		 518 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  22.88 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  22 
 
 		 272 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  22 
 
 		 267 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  22 
 
 		 267 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  22 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.05 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  23.11 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  37.35 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13201  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  24.83 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 290 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  38.03 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  34.62 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  36.51 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  31.15 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  29.03 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  39.34 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  24.07 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0043  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.78 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  29.2 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  34.34 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.74 
 
 		 475 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  26.09 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  25.18 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  34.51 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0849  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.73 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  30.19 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  32.58 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  28.71 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  33.62 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.57 
 
 		 736 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  33.62 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  25.75 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>