More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4760 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 285 aa  563  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  36.67 
 
 		 308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  28.47 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  29.81 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  31.21 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  32 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  34.16 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 289 aa  92  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 586 aa  85.9  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.19 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  29.82 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  21.9 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  21.9 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.5 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 545 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  21.53 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  21.53 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  21.53 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 588 aa  65.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.53 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  21.53 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  21.17 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.17 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  24.52 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  48.81 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  21.17 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  22.79 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  27.08 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  24.77 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  28.93 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.63 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0557  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>