More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3529 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 		 294 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  42.07 
 
 		 300 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  41.72 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  42.41 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  41.03 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  41.38 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  41.03 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  41.03 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  41.03 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  41.03 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  40.69 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  39.16 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 284 aa  92.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  26.32 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.34 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  24.66 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  25.43 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.61 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 324 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  25.26 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  24.65 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  25.44 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  25.44 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  27.4 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  23.78 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  24.92 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  24.41 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  23.29 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  25 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  23.21 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  22.3 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  25 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  23.73 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>