More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2649 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
316 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  50.34 
 
 
291 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  46.62 
 
 
300 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  43.15 
 
 
279 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 
309 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 
309 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
309 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  33.8 
 
 
304 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  32.85 
 
 
297 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
297 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 
275 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  30.32 
 
 
295 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  37.65 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  27.94 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
299 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 
298 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  31.58 
 
 
308 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
294 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
304 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
304 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
304 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
321 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 
248 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  36.53 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  30.87 
 
 
285 aa  95.9  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
310 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
282 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
586 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  29.03 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  27.06 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  27.6 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  33.58 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  32.72 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
272 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 
274 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  27.21 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 
281 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  26.01 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
273 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.09 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
290 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  26.86 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
545 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  26.6 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3244  prolyl aminopeptidase  40.86 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  35.25 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5124  prolyl aminopeptidase  40.86 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  30.98 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
278 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  35.33 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  29.82 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  27.24 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  33.59 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  33.59 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  33.59 
 
 
323 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  26.88 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  25.69 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
272 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  35.29 
 
 
328 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  25.91 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  29.37 
 
 
272 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
273 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  25.69 
 
 
313 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
286 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
284 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
246 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
250 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  34.35 
 
 
339 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  31.11 
 
 
319 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
272 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
276 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  40.96 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0455  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.37 
 
 
370 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>